TABLE 1.

Gene-specific primers used for real-time RT-PCR assays

TargetSequenceaAmplicon size (bp)
18SF, 5′-CACGACGGAGTTTCACAAGA-3′
R, 5′-CGATGGAAGTTTGAGGCAAT-3′135
CDC21 F, 5′-TGTTGCTGGCTCTACTGATGCT-3′
R, 5′-GATGAGTCAACCCTAATTTGTCCAA-3′104
CDR1 F, 5′-ATTCTAAGATGTCGTCGCAAGATG-3′
R, 5′-AGTTCTGGCTAAATTCTGAATGTTTTC-3′140
CTA1 F, 5′-ATTTCATCCACACCCAAAAGAGA-3′
R, 5′-TTGCTAGTCAAGTAATCCCAAAACA-3′79
DDR48 F, 5′-TTCGGTAAAGACGACGACAAAGA-3′
R, 5′-GCCAAATGAAGAGGATCCATAAGA-3′108
ERG16 F, 5′-TTTAGTTTCTCCAGGTTATGCTCAT-3′
(ERG11)R, 5′-ATTAGCTTTGGCAGCAGCAGTA-3′100
GSL22 F, 5′-GGTGGAATCATTGCCGTCTT-3′
R, 5′-TTTCGGACACTTCCTGACACAA-3′81
SKN1.3 F, 5′-AACCAGAATACAAATCGGTCAAGTT-3′
R, 5′-ATCTATCGTACCCTGCTGATGTTG-3′70
YHB1 F, 5′-AAGTTGCTCCTCCTGCTGGTAAT-3′
R, 5′-TCCTTGTCTGTAGCTGGGTCATAGA-3′52
YNK1 F, 5′-TCAGAGGTGATTTGCCATTGAT-3′
R, 5′-ATTCTTCTTTCTTGAACCACAAGTCA-3′106
  • a F, forward; R, reverse.