TABLE 1.

Primers used in PCRs

PrimerPrimer sequenceReference
Global CTX primers
    PANCTX-M.F5′-TTTGCGATGTGCAGTACCAGTAA-3′8
    PANCTX-M.R5′-CGATATCGTTGGTGGTGCCATA-3′8
CTX-M group-specific primers
    CTXM.groupI.F35′-GACGATGTCACTGGCTGAGC-3′19
    CTXM.groupI.R25′-AGCCGCCGACGCTAATACA-3′19
    CTXM.groupII.TOHO1.2F5′-GCGACCTGGTTAACTACAATCC-3′19
    CTXM.groupII.TOHO1.1R5′-CGGTAGTATTGCCCTTAAGCC-3′19
    CTXM8.WSAgroupIII.F5′-AGACCTGATTAACTACAATCCCATTA-3′This study
    CTXM8.WSAgroupIII.R5′-ACTTTCTGCCTTCTGCTCTGGC-3′This study
    CTXM914.groupIV.F5′-GCTGGAGAAAAGCAGCGGAG-3′19
    CTXM914.groupIV.R5′-GTAAGCTGACGCAACGTCTG-3′19
Miscellaneous primers
    TEM.F5′-ATAAAATTCTTGAAGACGAAA-3′12
    TEM.R5′-GACAGTTACCAATGCTTAATCA-3′12
    SHV.F5′-GGGTTATTCTTATTTGTCGC-3′12
    SHV.R5′-TTAGCGTTGCCAGTGCTC-3′12
    CTX.F5′-AAAAATGATTGAAAGGTGGTTGT-3′12
    CTX.R5′-TTACAGCCCTTCGGCGATGA-3′12
    OXA-1A5′-CCA AAG ACG TGG ATG-3′23
    OXA-1R5′-GTT AAA TTC GAC CCC AAG TT-3′23